Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
APOFQ13790 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
APOFQ13790 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
APOFQ13790 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
APOFQ13790 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
APOFQ13790 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
APOFQ13790 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
APOFQ13790 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
APOFQ13790 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms