Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CLN3Q13286 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CLN3Q13286 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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