Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRIM28Q13263 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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