Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
NME3Q13232 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
NME3Q13232 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
NME3Q13232 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
NME3Q13232 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NME3Q13232 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NME3Q13232 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NME3Q13232 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NME3Q13232 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NME3Q13232 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NME3Q13232 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NME3Q13232 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NME3Q13232 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms