Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

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Length 2,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
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ACACAQ13085 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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ACACAQ13085 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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ACACAQ13085 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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ACACAQ13085 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
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ACACAQ13085 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC0.68□□□□□ -2.3
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ACACAQ13085 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
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ACACAQ13085 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
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ACACAQ13085 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ACACAQ13085 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
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