Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NFX1Q12986 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
NFX1Q12986 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
NFX1Q12986 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
NFX1Q12986 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFX1Q12986 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFX1Q12986 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFX1Q12986 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFX1Q12986 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFX1Q12986 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFX1Q12986 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFX1Q12986 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NFX1Q12986 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFX1Q12986 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFX1Q12986 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFX1Q12986 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFX1Q12986 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFX1Q12986 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFX1Q12986 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFX1Q12986 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFX1Q12986 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFX1Q12986 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFX1Q12986 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFX1Q12986 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFX1Q12986 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFX1Q12986 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFX1Q12986 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NFX1Q12986 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.9 ms