Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRGP23470 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRGP23470 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms