Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl40Q9Z2Q5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms