Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ilf3Q9Z1X4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ilf3Q9Z1X4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms