Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VarsQ9Z1Q9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VarsQ9Z1Q9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms