Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cldn13Q9Z0S4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cldn13Q9Z0S4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cldn13Q9Z0S4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn13Q9Z0S4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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