Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psma4Q9R1P0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms