Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms