Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Opn4Q9QXZ9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Opn4Q9QXZ9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Opn4Q9QXZ9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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