Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mid2Q9QUS6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms