Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmod4Q9JLH8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod4Q9JLH8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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