Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnmb4Q9JIN6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms