Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl28Q9JIL2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl28Q9JIL2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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