Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA7

Sphk2, Sphingosine kinase 2, mousemouse

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Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sphk2Q9JIA7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sphk2Q9JIA7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sphk2Q9JIA7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk2Q9JIA7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms