Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms