Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx12Q9ER00 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms