Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trmt112Q9DCG9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trmt112Q9DCG9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trmt112Q9DCG9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trmt112Q9DCG9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms