Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc89Q9DA73 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc89Q9DA73 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms