Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N5

Cib4, Calcium and integrin-binding family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib4Q9D9N5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib4Q9D9N5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cib4Q9D9N5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms