Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn22Q9D7U6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn22Q9D7U6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms