Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Capns2Q9D7J7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capns2Q9D7J7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capns2Q9D7J7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Capns2Q9D7J7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capns2Q9D7J7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Capns2Q9D7J7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capns2Q9D7J7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Capns2Q9D7J7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Capns2Q9D7J7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Capns2Q9D7J7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Capns2Q9D7J7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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