Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam227bQ9D518 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam227bQ9D518 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms