Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930556J24RikQ9D4U7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms