Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mis18aQ9CZJ6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mis18aQ9CZJ6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mis18aQ9CZJ6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mis18aQ9CZJ6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mis18aQ9CZJ6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mis18aQ9CZJ6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mis18aQ9CZJ6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mis18aQ9CZJ6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mis18aQ9CZJ6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mis18aQ9CZJ6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mis18aQ9CZJ6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mis18aQ9CZJ6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mis18aQ9CZJ6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mis18aQ9CZJ6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mis18aQ9CZJ6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mis18aQ9CZJ6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms