Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nde1Q9CZA6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms