Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mis12Q9CY25 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mis12Q9CY25 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms