Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Xrcc3Q9CXE6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Xrcc3Q9CXE6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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