Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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RpainQ9CWY9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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RpainQ9CWY9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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RpainQ9CWY9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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RpainQ9CWY9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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RpainQ9CWY9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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RpainQ9CWY9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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RpainQ9CWY9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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RpainQ9CWY9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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RpainQ9CWY9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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RpainQ9CWY9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RpainQ9CWY9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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