Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MINDY3Q9CV28 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms