Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CRC3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CRC3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CRC3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CRC3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms