Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pagr1aQ99L02 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms