Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJD4Q96KN9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJD4Q96KN9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms