Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf144aQ925F3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms