Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atl3Q91YH5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atl3Q91YH5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms