Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac11Q91WA3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms