Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ccdc58Q8R3Q6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ccdc58Q8R3Q6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ccdc58Q8R3Q6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ccdc58Q8R3Q6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Ccdc58Q8R3Q6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ccdc58Q8R3Q6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ccdc58Q8R3Q6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms