Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pitrm1Q8K411 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pitrm1Q8K411 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms