Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1M4

Glis1, Zinc finger protein GLIS1, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis1Q8K1M4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Glis1Q8K1M4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms