Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms