Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rufy1Q8BIJ7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms