Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.2Q85ZW9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-M10.2Q85ZW9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms