Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ScocQ78YZ6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScocQ78YZ6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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