Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms