Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SynmQ70IV5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms