Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms